Piętnaście lat po Drugim Uderzeniu zobojętniały nastolatek Shinji dołącza do grupy swojego ojca, by walczyć z aniołami. Wszystkich może jednak zniszczyć prawda.
W Instytucie Cybernetycznym w Tsukuba w Japonii naukowcy pracują nad najdoskonalszym tworem myśli technicznej jaki kiedykolwiek pojawił się na ziemi - Mechagodzillą. Jest to śmiercionośna maszyna, elektroniczny potwór, niezwyciężona forteca zbudowana na podobieństwo Godzilli. W tym samym...
Kosmici próbują przejąć kontrolę nad Ziemią. W razie gdyby Godzilla miał się im przeciwstawić budują mechaniczną wersję stwora - Mechagodzillę. Ludzie wzywają legendarnego Seesara by pomógł Godzilli w walce.
Królestwo Seatopii wysyła na powierzchnię Ziemi Megalona i Gigana, by zniszczyli ludzkość. Godzilla przy pomocy skonstruowanego przez naukowców robota podejmuje walkę z agresorami.
Przyszłość. Grupa bandytów pod przywództwem Wa-Lee, przejmuje kontrolę nad ostatnim, gigantycznym robotem MRAS-2. Wykorzystując maszynę Wa próbuje rozpętać wojnę z Eastern Alliance. Jedyną nadzieją na uniknięcie konfliktu jest zniszczenie MRAS-2, czego dokonać może jedynie inny...