W filmie splatają się trzy wątki. Pierwszy to losy Chrystusa począwszy od narodzin, poprzez ucieczkę do Egiptu, chrzest, aż po nauczanie i cuda. Drugi przedstawia dwór Heroda oraz niespokojne czasy panowania Poncjusza Piłata. Trzeci, najbardziej kontrowersyjny, przedstawia Barabasza jako...
Dwie kobiety, właścicielka salonu gry Vienna i farmerka Emma, kochają tego samego mężczyznę. Jest nim były rewolwerowiec, tytułowy Johnny Guitar, pracujący dla Vienny. Gdy ginie brat Emmy, oskarża ona bandytę, który przebywał często w salonie Vienny.
